Редкие виды растений можно встретить в столичных природных зонах, включая национальный парк "Лосиный Остров", особо охраняемые территории и речные поймы. Среди них – краснокнижные орхидеи, численность которых в Москве постепенно восстанавливается. Биологи Департамента природопользования и охраны окружающей среды отмечают, что в городе всё чаще встречаются такие редкие представители флоры, как любка двулистная, дремлик болотный и пальчатокоренник балтийский.
По мнению специалистов, во многом этому способствует Красная книга Москвы. Юрий Насимович, кандидат биологических наук и один из авторов очерков Красной книги, считает, что благодаря ей люди стали бережнее относиться к природе. Он отмечает, что сегодня москвичи осознаннее подходят к вопросам экологии и всё реже срывают дикие цветы, понимая их важность для природных экосистем.
Одним из редчайших видов столицы считается любка двулистная, известная также как ночная фиалка. Это травянистое растение с нежными белыми цветами может достигать 50 сантиметров в высоту. Ежегодно оно формирует новый клубень, заменяя старый. Листьев у него немного — от одного до трех, их длина варьируется от 8 до 22 сантиметров, а ширина составляет от 3 до 6 сантиметров. Соцветие напоминает вытянутый цилиндр высотой около 20 сантиметров. Цветение начинается спустя шесть-семь лет после появления ростка и приходится на июнь—июль. В ночное время растение источает характерный сладкий аромат. В Москве любка двулистная встречается в природно-историческом парке "Битцевский лес", на территории ТиНАО, в ландшафтном заказнике "Теплый Стан" и в национальном парке "Лосиный Остров".
Ещё один представитель краснокнижной флоры — пальчатокоренник балтийский. Этот вид орхидей занесен в Красную книгу под второй категорией редкости. У него толстый полый стебель высотой до 60 сантиметров и несколько длинных узких листьев с характерными тёмными пятнами. Соцветия плотные, колосовидные, светло-фиолетового оттенка. Лепестки отличаются разнообразием форм: некоторые загнуты назад, другие имеют округло-ромбическую или треугольную форму, на губе цветка заметны тёмные пятна. Цветение начинается в середине июня и продолжается до середины июля. В Москве этот вид можно встретить в "Серебряном бору", на Строгинском мысе, в национальном парке "Лосиный Остров", а также на берегах реки Котловки, где в последние годы наблюдается активное цветение растения.
Дремлик болотный, занесенный в Красную книгу Москвы как вид первой категории редкости, отличается высотой до 80 сантиметров и длинным разветвленным корневищем. Его листья очередные, продолговатые, верхние — заметно мельче нижних. Цветение начинается на 10–11-й год жизни. Цветки кремово-белые с фиолетовыми прожилками, собраны в соцветия по 6–12 бутонов. Лепестки могут иметь бурый оттенок с белыми полосами, оборками и небольшими крапинками. Нектар этого растения обладает особым эффектом: он слегка усыпляет насекомых, заставляя их оставаться на цветке дольше и способствуя опылению. Иногда возможно и самоопыление. Период цветения приходится на июнь—июль. Дремлик болотный встречается в заболоченных лесах, на опушках, сырых лугах и полянах. В Москве его можно найти в Куркинской пойме реки Сходни, в национальном парке "Лосиный Остров" и на территории памятника природы "Тушинская чаша".