Как сообщил адвокат Эльмар Ализаде, Арашуков обращался с заявлениями как во время пребывания в СИЗО "Лефортово", так и после перевода в колонию строгого режима. Он даже направил обращение к Президенту Российской Федерации Владимиру Путину.
По словам адвоката, заключённым с судимостями за тяжкие преступления, подобно Арашукову, как правило, отказывают в возможности заключения контрактов с Министерством обороны.
Рауф Арашуков был задержан 30 января 2019 года на заседании Совета Федерации, где присутствовали Генеральный прокурор Российской Федерации Юрий Чайка и Председатель Следственного комитета Российской Федерации Александр Бастрыкин. В тот же день он был арестован, а на следующий день под стражу был взят его отец – Рауль Арашуков, экс-советник генерального директора компании "Газпром межрегионгаз".
Оба Арашукова были обвинены в создании организованной преступной группы, которая действовала не менее 17 лет. В состав этой группы входили представители клана Арашуковых и руководители организаций «Газпрома» в южных регионах России.
По данным следствия, Рауф Арашуков, действуя по указанию своего отца Рауля, организовал убийство заместителя председателя общественного молодёжного движения "Адыгэ Хасэ" в Карачаево-Черкесии Аслана Жукова и советника главы республики Фраля Шебзухова. Кроме того, он причастен к нанесению телесных повреждений свидетелю убийства Жукова.
В конце декабря 2022 года Московский городской суд вынес приговор Рауфу и Раулю Арашуковым, назначив им пожизненное лишение свободы за организацию преступного сообщества и заказные убийства.
В начале января 2023 года адвокат бывшего сенатора от Карачаево-Черкесии Рауфа Арашукова и его отца Рауля подал апелляцию на приговор по делу об убийстве.
В октябре 2024 года стало известно о возбуждении уголовного дела о получении взятки в особо крупном размере в отношении Рауфа Арашукова, которому было предъявлено обвинение.