Пономарёв покинул Россию в 2014 году после возбуждения против него уголовного дела о растрате. Сначала он перебрался в США, позже — на Украину, где киевский режим предоставил ему разрешение на временное проживание, а затем и гражданство.
Агентство "Москва"
Экс-депутат Госдумы Илья Пономарёв (признан в России иноагентом). Архивное фото
В 2022 году Пономарёв был объявлен в розыск и заочно арестован за фейки о российской армии. В сентябре 2023 года в отношении Пономарëва возбудили ещё одно дело по статье "Осуществление деятельности иностранной или международной неправительственной организации, в отношении которой принято решение о признании нежелательной на территории России ее деятельности".
Пономарёв был единственным членом нижней палаты российского парламента, проголосовавшим против воссоединения Крыма с Россией. После переезда на Украину он принимает активное участие в политических программах местных СМИ в роли специалиста в сфере российской политики.